Институт защиты растений, являющийся одним из ведущих институтов университета, был основан в начальный период создания Шэньянского аграрного университета в 1952 году.
 После создания института 50 лет спустя, несколько поколений сотрудников стремится к высшему качеству образования. Институт защиты растений осуществляет подготовку четырех магистерских и докторских программ по специальностям: патология растений, сельскохозяйственная энтомология и борьба с вредителями, сельскохозяйственная фармакология, борьба с вредителями и экологическая безопасность. В том числе дисциплина патологии растений является ключевой дисциплиной министерства сельского хозяйства и провинции Ляонин. Дисциплины сельскохозяйственной энтомологии и борьбы с вредителями, сельскохозяйственной фармакологии являются важными на уровне провинции.
  В институте существует две программы подготовки бакалавриата: защиты растений и прикладной химии. В настоящее время работает 42 сотрудника, в том числе 12 профессоров, 12 доцентов. До сих пор, научно-исследовательские работы в области растительных болезней и насекомых-вредителей кукурузы, пшеницы, сои, риса, овощей и китайской традиционной медицины получили  большие достижения. Более 500 научных работ опубликовано в различных журналах. Международные связи и сотрудничество интститута очень обширны. Интститут уже успешно провел три международных учебных семинара по теории защиты растений и техники.